Bioinformatique

             Ce cours intitulé : Bio-informatique, est un cours destiné aux étudiants de master 01, Qualité et métrologie Appliquée à l'Agronomie. L’objectif de ce cours développer les compétences théoriques et pratiques nécessaires à l'analyse des données des biologique en leur faisant découvrir les techniques et les outils utilisés dans cette discipline.

             Le cours est divisé en un ensemble d’unités d’apprentissage qui vous permettent d’acquérir des connaissances sur l’évolution de la bio-informatique, son rôle et les différentes banques de donnée biologiques Le cours permet, également aux étudiants l’acquisition des connaissances sur les méthodes d’analyse du génome et la modélisation de l'évolution d'une population animale dans un environnement donné, en passant par la modélisation moléculaire, l'analyse d'image, l'assemblage de génome et la reconstruction d'arbres phylogénétiques.

Visées d’apprentissage

La compétence visée par ce cours, dans son ensemble, est que « L'étudiant doit être capable d’effectuer une recherche de f açon méthodique dans les différents base de données qu’elles soit nucléique ou protéique et d’entirer profil de cette recherche , identifier et comparer des séquences recherchées dans ces banque de données , s’ajoute à cela il aura l’aptitude à étudier les liens de parenté entre les espèces à travers la maitrise  des différentes méthodes de comparaison des séquences et d’analyse phylogéniques »

Les objectifs du cours sont présentés comme suit :

✓ Comprendre les différentes notions de la bio-informatique.

✓ Connaître l'histoire et l'évolution de la bio-informatique.

✓ Identifier les principaux objectifs de bio-informatique et ses domaines d’application.

✓ Identifier le contenue d'une base de données biologique.

✓ Représenter les Rôles des banques de données.

✓ Différencier entre Les types des bases de données biologique.

✓ Comparer entre les bases de données généralités et les bases de données spécialisées.

✓ Connaitre les différents types de mutation ponctuelles sur les séquence nucléique et

protéique.

✓ Etudier et Maitriser les différentes méthodes de comparaison des séquences biologiques.

✓ Comprendre les différentes notions de bases de la phylogénie

✓ Connaitre les domaines d’application de la phylogénie

✓ Maitriser les différentes méthodes d’analyse phylogénétique en vue de la construction

d’un arbre phylogénétique.

✓ Illustrer les principales étapes de construction d’un arbre phylogénétique.